北京超算+深势科技,共同打造药物计算新范式

2022-07-27 14:46  来源: it资讯网

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  医药产业是与国民经济和民生息息相关的基础和战略性产业。根据《Nature》报道,新药开发的平均成本约为26 亿美元,大约需要10 年,包括小分子化合物的长期开发阶段、Ⅲ期临床试验以及注册批准过程,其中,只有不到1 /10 的药物可以成功通过并上市。高投入、高风险、低回报,一直是药企新药研发的痛点。

  而人工智能技术的出现,给整个医药领域带来巨大的变革。借助AI模型介入靶点结构解析、预测与精修、苗头化合物筛选、先导化合物优化和ADME/T性质预测等诸多环节,能够有效加快药物研发速度,降低研发成本,提高研发成功率,进而提升药企的投资回报率。这种通过AI学习底层原理或解决底层问题,再进一步解决这些原理所映射的工业问题的方法,就是所谓的“AI for Science”新范式。

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  成立于2018年的深势科技,是AI for Science科学研究范式的先行者。深势科技致力于运用人工智能和分子模拟算法,结合先进计算手段求解重要科学问题,为人类文明最基础的生物医药、能源、材料和信息科学与工程研究打造新一代微尺度工业设计和仿真平台。创新性地融合了跨尺度建模、高效采样、高性能计算等技术,在保持量子力学精度准确性的基础上,将分子动力学的计算速度提升了数个数量级,从而解决药物和材料的微观计算模拟难题。

  在辅助药物研发、实现药物分子的理性发现和设计方面,深势科技推出的Hermite™药物计算设计平台,致力于为药物研发工作者提供临床前的一站式解决方案。平台融合了蛋白结构预测Uni-Fold、自由能微扰计算Uni-FEP等核心算法,为药物研发工作者提供了一系列全新的计算模拟及设计工具,已被国内外数十家创新药企和上千位学术用户广泛应用。同时,基于平台能力,深势科技与业内多家合作伙伴建立了十余条合作管线,覆盖包括CNS、肿瘤和自身免疫性疾病等领域,目前部分管线已处于Pre-PCC阶段。

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  公司核心团队由中国科学院院士领衔,主要来自北京大学、普林斯顿大学、约翰霍普金斯大学、复旦大学、中科院上海药物研究所、阿里、百度等世界一流高校、科研机构和企业,科研队伍由物理建模、数值算法、机器学习、高性能计算及药物和材料计算等多个领域的数十名优秀青年科学家构成。

  团队核心成员获得2020年全球计算机高性能计算领域的最高奖项“戈登贝尔”奖,相关工作也入选由中国科学院院士和中国工程院院士投票评选的2020年中国十大科技进展

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深度势能团队获得戈登贝尔奖,图源:深势科技

  在提供基础算力服务上,深势科技Hermite药物设计平台与北京超算合作,共同突破了药物设计平台基于超算架构的云原生技术,实现了在跨尺度建模、高效采样、高性能计算等技术上的创新突破,在保持量子力学精度准确性的基础上,将分子动力学的计算速度提升了数个数量级。

  北京超算充分发挥资源优势,为深势科技打造药物设计和材料研发平台提供了强有力的适配算力支撑,助力其实现真正的创新驱动发展,从以下方面为深势科技提供了强力护航:

  上万+核/上百+卡算力秒级汇聚,无需等待时间;

  裸金属CPU核心/GPU卡,节点间高速IB网络通信,以最低的价格实现最高的计算效率;

  从计算任务开始计算为计费起点,真正按需收费,精确到秒级;

  支持Docker,容器化调度等云原生技术,协助研发以及生产环境流程化协作;

  生命科学专业技术团队以及算法优化团队专业支持业务流全栈定制化服务;

  未来,北京超算将继续与深势科技这样的创新AI企业展开深度合作,将AI+HPC的模式推行至整个药物研发行业,助力AI制药生产实践难题破解,开辟企业降本增效新路径,共拓生命科学行业新生态。